Élevages durables : des animaux, des humains, des territoires

Le programme de recherche (PEPR) Élevages durables réunit la communauté scientifique et les professionnels de l’élevage pour accompagner la transition des élevages français vers des systèmes plus durables, conciliant viabilité économique et préservation des écosystèmes, des ressources, de la santé et du bien-être animal. Lancé les 25 et 26 juin 2026, il est doté d’un budget de 45 millions d’euros.

Publié le 25 juin 2026

© Nadezhda Moryak (Pexels)

L'élevage joue un rôle central dans la production alimentaire, la durabilité environnementale et le développement économique des territoires. Il est aujourd’hui confronté à de multiples défis : adaptation au changement climatique, risques sanitaires, attentes sociétales accrues vis-à-vis du bien-être animal, enjeux environnementaux et viabilité économique. Dans ce contexte, repenser les systèmes d’élevage devient essentiel pour les rendre plus résilients aux aléas, plus sobres et mieux intégrés aux territoires tout en restant compétitifs économiquement.

Des priorités de recherche 

Pour accompagner ces transitions, la recherche doit proposer des solutions concrètes et opérationnelles. Quatre grands axes structurent les besoins identifiés : 

  • Mieux prévenir et contrôler les risques sanitaires, dans un contexte de mondialisation des échanges, de changement climatique et de diversification des systèmes.
  • Placer le bien-être animal au cœur des pratiques, en développant des systèmes qui favorisent l’expression des comportements naturels des animaux.
  • Concevoir des systèmes d’élevage plus respectueux de l’environnement et des ressources, en s’appuyant sur les complémentarités entre espèces, cultures et territoires.
  • Intégrer les dimensions socio-économiques, afin de garantir la viabilité des exploitations et accompagner les transitions. 

Un programme ambitieux et fédérateur

Face à ces enjeux, le PEPR (programme et équipement prioritaire de recherche) Élevages durables, mis en place dans le cadre de l’Agence de programme Agralife et piloté par INRAE, vise à structurer la recherche française autour d’une vision agroécologique de l’élevage. L’objectif général du PEPR Élevages durables est d’apporter des connaissances pour accompagner la transition des élevages français vers davantage de durabilité (sociale, économique, sanitaire et environnementale).

« Le programme de recherche Élevages durables est le premier programme de recherche d’envergure nationale dédié à l’élevage. Il couvre l’ensemble des filières animales, des mollusques marins aux ruminants, en passant par les poissons », souligne Muriel Vayssier-Taussat, directrice de recherche INRAE et directrice du PEPR Élevages durables.

« L’implication de l’Anses dans le PEPR Élevages durables consacre le lien indissociable entre la recherche d'amont, l'évaluation des risques et la gestion de terrain. Qu'il s'agisse de biosécurité, d'antibiorésistance ou de bien-être animal, note contribution scientifique permet de fonder la durabilité des élevages sur des bases sanitaires solides, protectrices tant pour l'animal que pour l'humain », précise Eric Cardinale, directeur scientifique de la santé animale et du bien-être animal (Anses).

Le Cirad y apporte son expertise en zone tropicale et méditerranéenne y compris dans l’outre-mer français. « Nos travaux sur les systèmes d’élevage et les innovations territoriales, ainsi que sur les maladies émergentes, vectorielles et transfrontalières, susceptibles d’apparaître ou d’être introduites sur le territoire français, hexagonal ou ultramarin, sont essentiels dans le contexte de dérèglement climatique et de transition agricole », appuie Thierry Lefrançois, conseiller de la PDG (Cirad).

L’Ifremer y joue également un rôle clé. « Le continuum terre/mer est un élément essentiel à prendre en compte dans les contextes de sécurité alimentaire, de développement durable et de changements globaux », détaille Tristan Renault, chargé de mission auprès de la direction générale (Ifremer).

« Notre participation au PEPR Élevages durables nous permet de travailler sur des thématiques au cœur de nos missions, à savoir penser l’élevage de demain en cohérence avec les enjeux sanitaires, climatiques, sociétaux. Ce PEPR est complémentaire du projet Ambitions Élevages, piloté par Acta et auquel Idele et INRAE participent, davantage orienté vers les acteurs des filières et du développement. », ajoute Anne-Charlotte Dockès, directrice Approches sociales et transfert (Idele - Institut de l’élevage).

Six projets ciblés pour répondre aux besoins de multi‑performance

Le programme s’articule autour de 6 projets interconnectés, conçus pour répondre aux besoins de la multi-performance des élevages durables et ciblant :

  • La prévention et gestion des maladies infectieuses* (projets AVEEC, PRISM-E² et VACCINS), pour renforcer la résilience des élevages face aux épizooties et anticiper les émergences sanitaires.
  • Le bien-être des animaux (projet WELLFEST), afin d’identifier les pratiques favorables au bien-être et à la santé des animaux.
  • La préservation de l’environnement (projet CEDRE), dans le but de concevoir des systèmes d’élevages respectueux de l’environnement et des ressources.
  • La viabilité socio-économique (projet TRANSYSTOR) pour accompagner les transitions en garantissant la viabilité économique des élevages et leur attractivité pour les nouvelles générations.

* Exemples de maladies étudiées : dermatose nodulaire contagieuse, peste porcine africaine, syndrome dysgénésique et respiratoire du porc, fièvre catarrhale ovine, maladie hémorragique épizootique, fièvre West Nile, grippes, rhabdoviroses (truite), vibrioses (mollusques)…

Le PEPR Élevages durables, en quelques chiffres

Montant du financement : 45 M€

Financeur : France 2030

Durée : 5 ans

Démarrage : 1er mars 2026

Séminaire de lancement scientifique du projet : 25-26 juin 2026 à Paris

Nombre de partenaires : 17 (AgroParisTech, Anses, Bordeaux SciencesAgro, Cirad, ENVT, Idele, Ifip, Ifremer, INRAE, Inserm, Isara, Itab, Itavi, Oniris, Lyon-1 Université Claude Bernard, université de Lorraine, VetAgro Sup) représentant plus de 70 unités de recherche ou laboratoires.

En réunissant plus de 500 scientifiques et acteurs de terrain, le PEPR Élevages durables pose les bases d’une transformation profonde et collective des systèmes d’élevage français. 

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Catherine Foucaud-Scheunemann

Rédactrice

Contacts

Muriel Vayssier-Taussat

Directrice du programme national (PEPR) Elevages Durables

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