Les infrastructures et réseaux de MathNum
Le Département MathNum est fortement impliqué dans le pilotage d’infrastructures scientifiques d’intérêt collectif:
- l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), avec Genotoul Bioinfo à MIAT et MIGALE à MaIAGE, membres de l’IR INRAE BioinfOmics, pour la bioinformatique et l’analyse de données ‘omiques';
- Data Terra, au travers du (co-)portage par TETIS de Dinamis et du pôle Theia, centrées sur l’acquisition d’images satellitaires et la fourniture de services liés à la télédétection;
- la plateforme RECORD de modélisation pour les agroécosystèmes, géré par l’équipe RECORD de MIAT ;
- la suite OpenSilex et ses déclinaisons (e.g. PHIS pour la phénomique), développées par MISTEA, pour la représentation et la gestion de données d’expérimentation et l’extraction de connaissances;
- l’AgroTechnoPôle à TSCF (Clermont-Ferrand et Montoldre), sur les agroéquipements et la robotique;
- la plateforme d’épidémiosurveillance en santé végétale à BioSP, avec l’ANSES et la DGAL;
- la Forge MIA, gérée par un groupe pluri-unités, pour le dépôt et le partage de codes logiciels ouverts.
Les CATIs
(« Centres automatisés de traitement de l’information ») sont des collectifs d’informaticiens qui couvrent un champ de thématiques en lien avec le numérique à INRAE (chaînes de traitement et d’analyse des données « omiques », d’observation, d’instrumentation ou d’enquêtes, modélisation et calcul scientifique, etc.). Nos ingénieurs et plusieurs chercheurs du Département MathNum participent à l’animation scientifique ou opérationnelle de sept CATIs :
- BIOS4BIOL
- BOOM (bioinformatique)
- SysMics (biologie des systèmes)
- CODEX (ingénierie des connaissances)
- IMOTEP
- IUMAN (traitement de données et modélisation)
- PROSODIe (données et logiciels ouverts et reproductibles)