Corentin Lothodé, un expert de l’IA au service du phénotypage végétal

Ingénieur de recherche recruté à INRAE en 2025, Corentin Lothodé met aujourd’hui son expertise en modélisation et en intelligence artificielle au service du phénotypage végétal. Son parcours débute par une licence de mathématiques, suivie d’une formation en génie mathématique à l’INSA de Rouen, mêlant informatique et mathématiques, puis d’un master orienté vers le traitement multimédia. À ce stade, la biologie n’est pas encore au cœur de son quotidien, mais il cultive déjà un fort intérêt pour la modélisation et explique que ce qui l’intéresse, c’est de « mettre en équation les choses que l’on observe ».

Il commence sa carrière dans l’industrie en tant qu’ingénieur R&D dans une petite entreprise du secteur naval et des énergies renouvelables, où il effectue une thèse CIFRE sur la déformation des pales d’éoliennes sous l’effet des fluides. En 2018, il rejoint le CNRS pour travailler sur des phénomènes physiques complexes et développer de nouvelles méthodes dont la composante principale est le calcul à haute performance. Il y découvre des approches d’intelligence artificielle guidées par les lois physiques plutôt que par de grandes masses de données.

Son arrivée à INRAE marque une nouvelle étape. Il met désormais en œuvre des méthodes issues du deep learning pour répondre à des questions liées aux maladies des plantes et à leur dynamique. Du traitement d’images à la modélisation physique, il travaille sur des réseaux de neurones capables d’extraire des informations d’images issues d’expérimentations, d’approcher des équations décrivant la diffusion de ces maladies, et s’intéresse aussi à des projets de jumeaux numériques appliqués à la mécanique végétale.

Au sein de l’unité IRHS (Institut de Recherche en Horticulture et Semences), dans l’équipe ImHorPhen (Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage), Corentin Lothodé accompagne les chercheurs dans leurs besoins en analyses automatiques : extraction d’informations à partir d’images, mesure de caractéristiques des plantes, comptage de fruits ou traitement de données 3D. Il développe également des outils destinés à faciliter le travail des équipes, comme un dispositif d’automatisation du suivi de germination pour le GEVES.

Corentin Lothodé contribue également, par ses compétences en IA, aux activités de PHENOME, une infrastructure nationale dédiée au phénotypage végétal, et à son pendant européen EMPHASIS. Dans ce cadre, il développe des traitements automatisés pour les maladies des plantes, l’horticulture et les semences, et participe à une campagne nationale visant à recueillir les besoins des chercheurs en phénotypage.

Son rôle est celui d’un facilitateur, explique-t-il. Il écoute les besoins, identifie les blocages techniques et propose des solutions adaptées. Cette diversité de collaborations nourrit son intérêt pour un métier où l’IA devient un levier pour accélérer la recherche.