Vous allez adorer votre microbiote !

Comment prendre soin de son microbiote ?

Notre microbiote est composé de plus de 300 espèces différentes de microorganismes. Ils ne se nourrissent pas tous de la même chose et ne libèrent pas tous les mêmes petites molécules bénéfiques à notre santé. Alors pour prendre soin de son microbiote il faut manger diversifié. Et le petit péché mignon de ces microbes, ce sont les fibres des fruits et légumes. Ce que notre microbiote n’aime pas, c’est le stress. Il n’aime pas non plus les antibiotiques, car si ils détruisent les bactéries pathogènes mais aussi les « bonnes » bactéries. Alors les antibiotiques, ce n’est pas automatique, et surtout ça ne sert à rien si la maladie dont vous souffrez n’est pas d’origine bactérienne (pour les maladies d’origine bactériennes, ils sont bien sûr indispensables). Le microbiote n’aime pas non plus l’alcool, qui rend la barrière intestinale perméable et laisse passer dans le sang des molécules indésirables. Vous l’avez compris, pour prendre soin de son microbiote, c’est important d’avoir une alimentation équilibrée et diversifiée, de prendre soin de soi en faisant du sport et en limitant le tabac et l’alcool.

Est-ce utile de prendre des probiotiques ?

Les probiotiques ce sont des microorganismes vivants (bactéries, levures, champignons) que l’on retrouve naturellement dans les aliments fermentés tels que les yaourts, le fromage, la choucroute, le kombucha… et notre microbiote adore ça ! En effet, les scientifiques ont montré que la diversité des microorganismes qui composent le microbiote est un facteur clé de la symbiose. Consommer des microorganismes vivants est donc une bonne idée pour prendre soin de son microbiote. Jusqu’à présent les probiotiques utilisés sont des bactéries alimentaires : des lactobacilles et bifidobactéries que l’on retrouve dans les aliments fermentés ou les compléments alimentaires. Mais nous avons fait une découverte à INRAE : il est possible d’utiliser des bactéries issues de notre propre microbiote pour soigner des maladies ! C’est le cas par exemple pour la maladie de Crohn. Les chercheurs ont montré que la bactérie Faecalibacterium prausnitzi, que l’on surnomme Fprau, est absente du microbiote des patients atteints de cette pathologie. L’idée est alors de la faire se reproduire et de l’utiliser comme médicament pour soigner la maladie de Crohn. 

Avons-nous tous le même microbiote ?

Non ! Les scientifiques ont mis en évidence 3 grands types de microbiotes. Chacun de ces microbiotes est dominé par une espèce. Nous avons donc le microbiote Bacteroides, le Ruminococcus et le Prevotella. Le type de microbiote que l’on développe est lié à notre environnement et notre alimentation. Il existe aussi des microbiotes riches en termes de diversité de microorganismes et des microbiotes plus pauvres. Des premiers résultats montrent qu’un microbiote pauvre et de type Bacteroides est associé à un risque plus élevé de maladies cardiométaboliques (obésité, diabète, insuffisanse cardiaque, etc.).

Le transfert de microbiote

Est-il possible de transférer un microbiote d’un patient sain à un patient malade et cela soigne-t-il des pathologies ? Depuis plus de 10 ans, INRAE mène des recherches pour développer une technique de transfert de microbiote. Il s’agit d’administrer une suspension de selles de donneurs sains dans le système digestif d’un receveur malade. Cela permet de restaurer la richesse du microbiote du patient malade et ainsi d’avoir un effet sur la santé. Cette nouvelle pratique peut comporter des risques mais les résultats de nos études sont prometteurs. Aujourd’hui cette technique est autorisée uniquement pour une pathologie dont il n’existe aucun traitement efficace à ce jour : l’infection à la bactérie Clostridium difficile.