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Le projet européen GLOMICAVE : utiliser l’intelligence artificielle pour établir des relations entre génotypes et phénotypes dans 6 domaines d’application

Le nouveau projet H2020 GLOMICAVE (Global Omic Data Integration on Animal, Vegetal and Environment Sectors) a débuté le 1er novembre 2020 (2020-2024) et vise à développer une plateforme web d'intelligence artificielle (machine/deep learning) pour l’intégration de données omiques (transcriptomiques, protéomiques, métabolomiques) et phénotypiques en complément d’informations recherchées dans des bases de données bibliographiques (text mining). INRAE est l’un des 15 partenaires du projet et le seul partenaire public français. Il se positionne ainsi comme un acteur incontournable de la biologie prédictive des plantes. L’unité « Biologie du fruit et pathologie » (BFP) du centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux coordonne le volet « fruits » du projet GLOMICAVE.

Publié le 14 décembre 2020

© INRAE - A. Girard

L'approche intégrative de GLOMICAVE sera validée dans 3 secteurs industriels différents (élevage, agro-biotechnologie et environnement) répondant à des défis spécifiques pour 6 cas d’études : reproduction animale, qualité de la viande, croissance et qualité des fruits (y compris le statut d'infection virale des arbres), croissance des plantes, élimination/récupération du phosphore et production de bioénergie dans le cycle de l'eau urbaine. Cet outil aura pour but d’aider les experts et non-experts d’un domaine à identifier et mieux comprendre les liens entre génotype et phénotype.

 

La contribution de l'unité "Biologie du fruit et pathologie " (BFP) visera à mesurer les transcrits, protéines et métabolites de plusieurs espèces de fruits afin de construire des modèles prédictifs du développement. L’équipe « Métabolisme » de BFP poursuivra ainsi l’analyse multiniveaux du développement de 10 espèces de fruits démarrée avec le projet ANR FRIMOUSS. Deux autres unités INRAE sont également impliquées, « l’Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay” qui réalisera des analyses transcriptomiques, et “Génétique Quantitative et Évolution - Le Moulon” des analyses protéomiques, sur plusieurs espèces de fruits.

Ce projet est également l’occasion pour l’équipe Métabolisme de BFP de collaborer à nouveau avec le Centre de recherche de Jülich (Allemagne), et également d’interagir avec la société française AkiNaO. 

Communication Nouvelle-Aquitaine Bordeaux

Contact scientifique

Pierre Petriacq

Unité mixte de recherche « Biologie du fruit & pathologie » BFP (INRAE-Université de Bordeaux)

Le centre

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