Evaluer, préserver et rétablir la symbiose Homme-microbes

L’Homme microbien

Chaque jour, la recherche produit de nouvelles connaissances qui confirment le rôle des bactéries hébergées par le corps humain sur la santé et le bien-être. L’Homme héberge en effet autant de bactéries que de cellules humaines, qui sont en interaction dès sa naissance et tout le long de son existence. En particulier, ces bactéries protègent le corps humain contre la prolifération de bactéries de l’environnement, et stimulent en permanence ses défenses naturelles. Rien ne se passe au niveau du microbiote qui n’impacte l’Homme au niveau de la perméabilité intestinale, du tonus immunitaire ou inflammatoire, et du stress oxydant. Un dérèglement à l’un de ces quatre niveaux peut entraîner des ruptures dans la relation entre l’Homme et ses microbes et un basculement vers un état de pré-maladie ou de maladie, avec des retours en arrière parfois très difficiles.

Le projet de Joël Doré est précisément d’analyser ces interactions et d’imaginer de nouvelles solutions de prévention et de traitement des grandes maladies chroniques que sont l’obésité, le diabète, les maladies du foie, l’autisme, les maladies cardiovasculaires et certains cancers. Pour cela, le chercheur étudiera l’impact de la modification de certains paramètres, et en particulier de l’inflammation intestinale, sur le développement d’un état de pré-maladie. En parallèle une étude spécifique sur le diabète sera réalisée dans le cadre des cohortes Nutrinet-Santé et MetaCardis, explorant les facteurs de prédispositions à la maladie et les déviations constatées au niveau du microbiote. Le projet analysera des données d’observations sur l’Homme et sur l’animal. Un important volet de bio-analyse et de modélisation de la relation entre le microbe et l’hôte complètera l’exploration des relations entre l’Homme et ses microbes et permettra d’étudier les interactions entre les variations de caractéristiques de l’état de santé (inflammation, immunité, oxydation) et la composition du microbiote.

Le projet dispose d’une dotation de l’ERC de 2,5 Millions d’euros, pour 5 ans à partir du 1er janvier 2019, qui permettra le fonctionnement d’un collectif associant les compétences de l’institut Micalis, de Métagénopolis, de l’unité de recherche MaIAGE (Mathématique et informatique appliquées, du génome à l’environnement), du projet Nutrinet du CRESS (Centre de recherches épidémiologiques et biostatistiques Sorbonne Paris Cité) et d’une équipe de recherche de l’AP-HP (Assistance publique – Hôpitaux de Paris). Les ressources en présence seront renforcées par le recrutement de quatre jeunes docteurs en contrat post-doctoral, d’un(e) étudiant(e) en doctorat, d’un(e) technicien(ne) de laboratoire et d’une assistante de gestion.

Vers une nouvelle médecine

Fondé sur un ensemble de connaissance acquises, le projet Homo.symbiosus a l’ambition de franchir un pas dans la compréhension de la symbiose entre l’Homme et ses microbes, qui ouvre la voie à de nouveaux traitements mais aussi, plus généralement, à de nouvelles approches médicales. Cette exploration suppose le passage d’une vision centrée sur les symptômes ou même les organes, à une analyse plus globale prenant en compte les paramètres relatifs à la composition du microbiote, à la perméabilité intestinale, à l’inflammation et au stress oxydant. Le projet de Joël Doré répond à l’urgence d’avancer sur ce terrain alors que l’incidence de l’obésité, du diabète, des maladies du foie et des maladies cardiovasculaires, augmente rapidement depuis soixante ans, en grande partie de façon incontrôlée, et que les solutions thérapeutiques disponibles ne sont pas toujours efficaces sur le long terme.