Alimentation, santé globale 3 min
Une étape franchie à Toulouse dans l’étude des petites molécules des organismes vivants
C’est dans le cadre de l’opération « métabolomique horizon 2020 » soutenue par l’Etat, la région Occitanie et Toulouse Metropole qu’INRAE Occitanie-Toulouse a pu renforcer son potentiel de recherche et d’innovation dans ce champ puissant d’étude et de caractérisation du vivant qu’est la métabolomique. La plateforme Metatoul a ainsi réceptionné sur le site du laboratoire de Toxicologie alimentaire un système d’imagerie par spectrométrie de masse, véritable « microscope chimique » qui permet la localisation spatiale précise d’une espèce moléculaire.
Publié le 18 novembre 2020
Le projet Métabolomique - Horizon 2020 s'inscrit dans le cadre du CPER 2014-2020 et vise à renforcer le potentiel de recherche, de développement et d'innovation en Occitanie dans les domaines de la santé, des biotechnologies et des agrobiosciences. Il vise plus spécifiquement à renforcer la structuration et la mutualisation des compétences régionales dans le domaine récent de la métabolomique.
Un potentiel scientifique de haut niveau technologique
L'acquisition de ce nouvel équipement élargit le champ d'exploration du métabolisme et ouvre des perspectives nouvelles. Cet instrument donne en effet accès à la détermination de la distribution et de la localisation spatiale des métabolites au sein d’un tissu ou d'un organe, avec des résolutions spatiales compatibles avec l'échelle cellulaire. Ceci permet de dresser de véritables cartographies moléculaires et d'aborder le métabolisme in situ. De plus cet équipement est doté d’une cellule de mobilité ionique qui offre de nouvelles possibilités pour la caractérisation des métabolites, l’identification de biomarqueurs, ou la distinction d'espèces moléculaires structuralement proches.
Ces développements donnent une nouvelle dimension à l'analyse du métabolome, notamment pour de nouvelles applications dans les domaines de la santé (cancérologie, maladies métaboliques, maladies infectieuses) et de la toxicologie.
Un environnement toulousain foisonnant et structurant
Le site toulousain regroupe un potentiel important de compétences scientifiques, techniques et analytiques. La plateforme de Métabolomique et Fluxomique de Toulouse (MetaToul), l'une des plateformes les plus récentes de la Génopôle de Toulouse, résulte de la structuration de ce potentiel et constitue aujourd’hui la plus importante plateforme de métabolomique et fluxomique en France. C'est une plateforme multi-organismes (INRAE, CNRS, Inserm, Université Paul Sabatier, INSAT, INP, Hôpitaux de Toulouse), labellisée IBiSA et certifiée ISO 9001. Elle est fondatrice et partenaire de l'Infrastructure Nationale de métabolomique MetaboHUB, avec les plateformes de Bordeaux, Clermont-Ferrand et Saclay.
Dans ce contexte, l’acquisition de cet instrument s’inscrit dans le projet « Métabolomique Horizon 2020 » qui vise à consolider le dispositif de la plateforme pour répondre aux défis majeurs posés par la biologie intégrative et à renforcer sa compétitivité, avec deux objectifs spécifiques :
- Répondre à une demande croissante des laboratoires de recherche publique et des entreprises privées
- Préparer la métabolomique de nouvelle génération.
Au niveau régional. cet équipement s'inscrit dans le cadre structurant de la Génopole de Toulouse (Genotoul) à travers laquelle la plateforme MetaToul est adossée à des laboratoires développant des programmes sur les questions de santé liées à l'alimentation (Laboratoire de Toxicologie Alimentaire), le diabète, l'obésité et le vieillissement (Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires) , la valorisation du carbone renouvelable (Toulouse Biotechnology Institute) ou encore l'étude des interactions plantes/microorganismes (Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales) .
Sur le plan National, les principaux domaines d'activité de MetaToul (biotechnologies, interactions plante-microorganisme, santé, toxicologie) sont complémentaires de ceux des autres plateformes françaises d'envergure nationale, en particulier les plateformes IBiSA de Bordeaux (métabolomique végétale), Clermont-Ferrand (nutrition) et Saclay (pharmacologie, métabolomique clinique), avec lesquelles MetaToul est partenaire de l’infrastructure nationale en métabolomique MetaboHUB, coordonnée par INRAE, et dont la gestion et le pilotage seront assurés depuis Toulouse à partir de janvier 2021.
Au niveau international, l'ambition de MetaToul est de se positionner comme un centre de référence au plan européen et mondial. Elle trouve sa concrétisation dans le cadre de l'infrastructure MetaboHUB, qui constitue un objectif affiché au travers de la participation à plusieurs instances et initiatives Européennes et internationales en métabolomique. La plateforme est également déjà partenaire de plusieurs projets et réseaux Européens et s'intègre dans plusieurs consortiums pour les programmes Europe horizon 2020.