Nouvelle série de webinaires MICA : "Construire de meilleurs écosystèmes : L'essor de l'écologie microbienne synthétique"

Une série de webinaires, proposée par le département MICA et intitulée : "Construire de meilleurs écosystèmes : L'essor de l'écologie microbienne synthétique" voit le jour, à partir de l'automne 2025. N'hésitez pas à réserver les dates dans vos agendas.

Publié le 18 juillet 2025

© INRAE Françoise Irlinger UMR SayFood

Le département MICA propose une nouvelle série de webinaires sur le thème de l'écologie microbienne synthétique pour construire de meilleurs écosystèmes microbiens.

Ces webinaires mensuels s'adressent à un public international de chercheurs et d'étudiants, et visent à favoriser les échanges avec les experts de cette discipline. 

L'étude du rôle biologique des communautés microbiennes est complexe et constitue un véritable défi scientifique. Cependant, les connaissances acquises dans ce domaine offrent un potentiel considérable pour des applications dans de nombreux domaines des sciences de la vie, de la santé à l'environnement. 

En effet, en décryptant les interactions entre les espèces au sein des communautés microbiennes et la manière dont ces espèces interagissent avec leur biotope, nous pouvons élaborer des stratégies pour concevoir des communautés en vue d'applications spécifiques.

L'écologie microbienne synthétique est une approche émergente. Elle est mise en œuvre par la conception et la construction de communautés microbiennes fondées sur les connaissances acquises. Le but recherché est de comprendre le fonctionnement de ces communautés afin d'adapter leurs propriétés. Cette approche pourrait ouvrir la voie à de nouvelles technologies débouchant sur un large éventail d'applications, notamment pour la bioremédiation, la production de biocarburants, les fermentations alimentaires et la médecine.

Cette approche permet de construire en laboratoire des communautés microbiennes qui sont généralement composées d'un nombre limité de souches ou d'espèces sélectionnées pour leurs caractéristiques d'intérêt. 

Les chercheurs contrôlent donc, à la fois, la composition de ces communautés et leurs conditions de développement afin d'étudier les interactions entre les espèces et leur impact sur la fonctionnalité de la communauté. Ce cadre contrôlé permet finalement d'isoler et d'identifier les facteurs qui déterminent l'assemblage et la fonctionnalité de la communauté, fournissant ainsi des informations cruciales pour le développement de nouvelles méthodes d'ingénierie du microbiome.

L'écologie microbienne synthétique : une discipline en plein essor

L'écologie microbienne synthétique fait actuellement l'objet d'un intérêt grandissant, stimulée par les progrès du séquençage à haut débit, des méthodes omiques (notamment la métagénomique et la méta-transcriptomique), de la modélisation à l'échelle du génome, des technologies d'édition du génome et des nouvelles stratégies de culturomique qui fournissent désormais les connaissances et les ressources microbiennes nécessaires à sa mise en œuvre. 

La collaboration entre chercheurs de diverses disciplines telles que l'écologie microbienne, la génomique, la bioinformatique et la modélisation est un élément clé et nécessaire pour contribuer au développement de ces nouveaux outils et technologies afin de libérer le potentiel de l'écologie microbienne synthétique. 

Cependant, malgré d'importantes avancées récentes, le domaine en est encore à ses balbutiements et est quelque peu désorganisé. Il n'y a par exemple pas de consensus sur les définitions fondamentales, les protocoles et les méthodologies.

Pour progresser collectivement, il est important que les chercheurs déjà actifs dans cette nouvelle discipline s'organisent. C'est pourquoi le département MICA lance une série de webinaires intitulée "Contruire de meilleurs écosystèmes : L'essor de l'écologie microbienne synthétique" avec l'objectif de rassembler la communauté intéressée par l'écologie microbienne synthétique et de favoriser la collaboration et la normalisation dans ce domaine.

À VOS AGENDA !

Les premiers webinaires débutent à l'automne 2025 et la série continuera jusqu'en juin 2026. Les webinaires sont tous prévus de 16h-17h : 

mardi 30 septembre 2025
 mardi 28 octobre 2025
 mardi 25 novembre 2025
 mardi 16 décembre 2025
 mardi 27 janvier 2026

-> Lors de tous les webinaires, l’intégralité des échanges se fera en langue anglaise. Les intervenants, les liens pour les inscriptions et connexions seront disponibles prochainement.

LAURENT MARCHÉ

Chargé de communication

Département Microbiologie et Chaîne Alimentaire

Contacts scientifiques

Eric DUGAT-BONY

Chargé de recherche INRAE

UMR Food and Bioproduct Engineering - SayFood

Thibaut Nidelet

Chargé de recherche INRAE

UMR Sciences pour l'oenologie

Kim Milferstedt

Directeur de recherche INRAE

Laboratoire de biotechnologie de l'environnement

Le département

En savoir plus

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